记者今天获悉,自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控中心已完成20例德尔塔新冠病毒基因组测序。已经完成测序功效的标本均为德尔塔毒株,与南京高度同源。
5天时间已完成20例标本测序
据省疾控中心检讨科科长湛志飞先容,基因组测序可在第一时间获取新发未知病毒的基因组序列信息,已成为研究疾病暴发的重要东西。通过构建进化树,研究差异患者病毒遗传序列变革,能在分子生物学层面展现病毒的流传方法,阐明新冠病毒的进化来历,研究新冠病毒的致病病理机制,为节制疫情暴发提供科学依据。
通过检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列通过算法与数据库中的数据举办比对,可以劈头判定其地区来历。将序列与既往病例序罗列办比对,假如序列在同一进化树分支上,则可以判定这些病例是否来自同一流传链或熏染源。
面临此次疫情,从7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,湖南省疾控已完成20例标本测序。
24小时完成病毒基因测序溯源
“新冠病毒样本送到尝试室后,一般需要颠末多个步调完成检测。”湛志飞称,在接到阳性样本后,事恋人员首先举办复核事情,对样本举办核酸提取,再用两种试剂举办核酸检测。复核阳性的标本,别离用二代和三代高通量测序技能举办序列测定,为病毒溯源事情配置“双保险”,确保万无一失。
病毒基因序列测定完成后,事恋人员还要马长举办生物信息学阐明,将病毒序列与数据库中的序罗列办比对,查察有无变异位点,举办同源性较量。完成数据比对后,还要实时撰写溯源陈诉。
“今朝,湖南省疾控中心已具备新冠病毒基因组高通量二代和三代测序本领,,为湖南省新型冠状病毒疫情以及其他熏染病病原体的判断和溯源、防控应对提供了强大的技能支撑。”湛志飞先容,去年10月份才把握这项技能,以前都是送到国度疾控中心检测。今朝湖南省疾控中心造就了3名技能主干,所有的新冠病毒基因组测序都能在24小时内完成,环境巨大的也不会高出48小时。按照疫情的变革,只要有标原来,城市在24小时内启动测序流程。
测序功效与南京高度同源
7月28日,接到2021年第一例本土新冠肺炎病例标本测序事情以来,省疾控中心当即组织专业技能人员,日夜不断地开展测序事情,通过文库制备、簇生成、上机测序与数据比对阐明,已经完成测序功效的标本均为德尔塔毒株。从国度疾控中心反馈的功效显示,和江苏省报送的南京疫情本土病例新冠病毒基因组序列高度同源。
按照最新疫情传递,2021年7月20日0时至8月1日24时,湖南省累计陈诉新型冠状病毒肺炎确诊病例22例。此次疫情病原体为德尔塔变异株,范畴广、来势猛,宽大公众必然不能掉以轻心,严格执行好持码收支、丈量体温、佩带口罩、保持间隔等法子,有效低落病毒流传风险,淘汰不须要的人员聚积。
原标题:湖南20例新冠病毒标本测序均为德尔塔毒株,与南京疫情高度同源 (责任编辑:壮盛军事网)